- Ecología de Comunidades y Macroecología (ECOMA)
- Ecología de Poblaciones
- Ecología de Roedores Urbanos
- Evolución
- Genética de Especies Leñosas (GEEL)
- Genética de la Estructura Poblacional (GEP)
- Genética de Poblaciones Aplicada (GPA)
- Genética Evolutiva de Resistencia al Estrés y Envejecimiento
- Grupo de Bioestadística Aplicada
- Grupo de Citogenética de Insectos
- Grupo de Estudio de Mosquitos (GEM)
- Grupo de Estudios de Sistemas Ecológicos en Ambientes Agrícolas (GESEAA)
- Grupo de Estudios sobre Biodiversidad en Agroecosistemas (GEBA)
- Grupo de Investigación en Biología Evolutiva (GIBE)
- Grupo de Investigación en Ecología de Comunidades de Desierto (ECODES)
- Grupo de Investigación en Ecología de Humedales (GIEH)
- Grupo de Investigación en Filogeografía y Filogenias Moleculares (GIFF)
- Grupo Hidrobiología
- Laboratorio de Entomología Experimental (LEE)
- Laboratorio de Citogenética y Evolución (LaCyE)
- Laboratorio de Eco-Epidemiología
- Laboratorio de Ecología Funcional
- Laboratorio de Ecología y Comportamiento Animal
- Laboratorio de Ecología Marina Microbiana
- Laboratorio Genómica de Poblaciones y Evolución
- Limnologia